Aangezien het FAT32 is,
hang de schijf eens aan je pc, en draai checkdisk eens.
Waarschijnlijk dat dan je bestanden weer terug zijn.
Naar mijn mening is het beter om ext2/ext3 filesystem te gebruiken. (deze kan ook bestanden > 2gb aan, en is in deze omgeving stabieler)
Succes.