Не пишите ext2/3 с Windows. Используйте уж FAT32...
Видимо, у Вас проблемы с файловой системой этого диска. Мой совет Вам - перейдите на FAT32, раз у Вас Windows. И эти разделы в любом случае снова отформатируйте - думаю, на них ошибки.
Это полностью соответствует моему предположению.
Еще совет - убедитесь, что диску хватает питания как от компа, так и от роутера.
Если есть возможность - запитывайте его от отдельного источника.